Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP4CQ96CF2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms