Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1Q969G3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms