Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4DQ92854 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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