Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms