Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RGP1Q92546 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RGP1Q92546 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms