Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY2Q8WXA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms