Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms