Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP38Q8NB14 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP38Q8NB14 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms