Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CLDN19Q8N6F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN19Q8N6F1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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