Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC65Q8IXS2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC65Q8IXS2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms