Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC117Q8IWD4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC117Q8IWD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms