Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms