Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP2

KTN1, Kinectin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KTN1Q86UP2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
KTN1Q86UP2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KTN1Q86UP2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms