Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF554Q86TJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms