Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT9Q86SS6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT9Q86SS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms