Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC4Q7Z404 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC4Q7Z404 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms