Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APTXQ7Z2E3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms