Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRCQ7RTU9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms