Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms