Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms