Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UQCC3Q6UW78 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms