Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms