Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms