Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF613Q6PF04 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms