Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNNM4Q6P4Q7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms