Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms