Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL3Q6DD88 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms