Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VIRMAQ69YN4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms