Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA2Q69YH5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA2Q69YH5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms