Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL1Q5VZK9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL1Q5VZK9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms