Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms