Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms