Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CT47A1Q5JQC4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47A1Q5JQC4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms