Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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