Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms