Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RTL8BQ17RB0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RTL8BQ17RB0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RTL8BQ17RB0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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