Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF1Q15361 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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