Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PRKD1Q15139 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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