Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD3Q15054 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms