Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KARSQ15046 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KARSQ15046 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KARSQ15046 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms