Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DDX39BQ13838 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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