Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOFQ13790 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOFQ13790 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOFQ13790 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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