Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms