Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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