Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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