Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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