Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRDM2Q13029 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRDM2Q13029 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PRDM2Q13029 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
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