Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIAQ12857 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
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