Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
HMGXB3Q12766 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HMGXB3Q12766 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
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