Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 AIM44YPL158C 2277 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 ALA1YOR335C 2877 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 MET5YJR137C 4329 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 SRP14YDL092W 441 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YNL114CYNL114C 372 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 RGR1YLR071C 3249 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 IRR1YIL026C 3453 nt3.27□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 MNE1YOR350C 1992 nt3.26□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 ROM1YGR070W 3468 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 FMP16YDR070C 282 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YDR186CYDR186C 2634 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YNL144CYNL144C 2223 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 UTP14YML093W 2700 nt3.25□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 DAN4YJR151C 3486 nt3.24□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 KAP123YER110C 3342 nt3.24□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 RPL20AYMR242C 519 nt3.24□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 NEW1YPL226W 3591 nt3.23□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 SPA2YLL021W 4401 nt3.23□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 ZIP2YGL249W 2115 nt3.23□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 RCY1YJL204C 2523 nt3.23□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 SET3YKR029C 2256 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 PBY1YBR094W 2262 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 GIS1YDR096W 2685 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 STU2YLR045C 2667 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 PTP3YER075C 2787 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 RPL42BYHR141C 321 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 SWI6YLR182W 2412 nt3.22□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 ITC1YGL133W 3795 nt3.21□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 FAP7YDL166C 594 nt3.21□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 YPR089WYPR089W 2667 nt3.21□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SNT1YCR033W 3681 nt3.21□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 HSH155YMR288W 2916 nt3.2□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 OSH3YHR073W 2991 nt3.2□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 RPS21AYKR057W 264 nt3.2□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 snR76snR76 109 nt3.19□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt3.19□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 RGM1YMR182C 636 nt3.19□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 UBP11YKR098C 2154 nt3.19□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SSM4YIL030C 3960 nt3.19□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 NET1YJL076W 3570 nt3.18□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 FLO1YAR050W 4614 nt3.18□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 DYN2YDR424C 279 nt3.18□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 NOP10YHR072W-A 177 nt3.18□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 ANB1YJR047C 474 nt3.18□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 CHS6YJL099W 2241 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SLY1YDR189W 2001 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SSN2YDR443C 4263 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SPT4YGR063C 309 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 COX12YLR038C 252 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 RPS30BYOR182C 192 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 MET6YER091C 2304 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 NUP100YKL068W 2880 nt3.17□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 YKU80YMR106C 1890 nt3.16□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 DUG2YBR281C 2637 nt3.16□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 YIL169CYIL169C 2988 nt3.16□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 HRD3YLR207W 2502 nt3.16□□□□□ -1.9
SRF1Q12516 SMY1YKL079W 1971 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 IFH1YLR223C 3258 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 AUS1YOR011W 4185 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 SLD3YGL113W 2007 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 FLO9YAL063C 3969 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 PIP2YOR363C 2991 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 GCV2YMR189W 3105 nt3.15□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YNL018CYNL018C 1839 nt3.14□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 DNL4YOR005C 2835 nt3.14□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 FKS3YMR306W 5358 nt3.14□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.14□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 PDR8YLR266C 2106 nt3.14□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 NAM7YMR080C 2916 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 MSB2YGR014W 3921 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 VTC3YPL019C 2508 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YFL065CYFL065C 309 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 RPL42AYNL162W 321 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YPR203WYPR203W 309 nt3.13□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 STB4YMR019W 2850 nt3.12□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 RIF1YBR275C 5751 nt3.12□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 CIN8YEL061C 3003 nt3.12□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 RRP6YOR001W 2202 nt3.12□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 RAD34YDR314C 2079 nt3.12□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 STT4YLR305C 5703 nt3.11□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.11□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 PRP5YBR237W 2550 nt3.11□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 ILS1YBL076C 3219 nt3.11□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 IRC8YJL051W 2469 nt3.11□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 STB6YKL072W 2301 nt3.1□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 FIR1YER032W 2631 nt3.1□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 SPO22YIL073C 2928 nt3.1□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 SPO14YKR031C 5052 nt3.1□□□□□ -1.91
SRF1Q12516 CRS5YOR031W 210 nt3.1□□□□□ -1.91
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